成果物名 | PoSSuM |
成果物の別名 | Pocket Similarity Search using Multiple-Sketches |
成果物に関する説明 | タンパク質の類似リガンド結合部位データベース |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://possum.cbrc.jp/PoSSuM/ | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/possum/desc.html |
インターフェイス | GUI |
入力例 | SearchK(http://possum.cbrc.jp/PoSSuM/search_k.html)メニューを開く。[PDB ID]テキストボックスに"1DJQ"を入力して、[HET code of ligand]テキストボックスに”ADP”を入力して、[Submit]ボタンを押す。 |
キーワード | タンパク質 | 基質結合部位 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0|なし |
使っている外部リソース | PDB|CATH |
主な対象データ | タンパク質-立体構造 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 6 |
最終更新日(調査日) | 2014/10/15 (2019/07/03) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | PDB(http://www.pdb.org/)|CATH(http://www.cathdb.info/)|School of Biological and Chemical Sciences(http://www.sbcs.qmul.ac.uk/) |
論文等(PubMed ID) | pmid:22113700 | pmid:22135290 | pmid:25404129 |
稼働状況 | 稼働中 |