データベース

PoSSuM

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成果物名PoSSuM
成果物の別名Pocket Similarity Search using Multiple-Sketches
成果物に関する説明タンパク質の類似リガンド結合部位データベース
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://possum.cbrc.jp/PoSSuM/ | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/possum/desc.html
インターフェイスGUI
入力例SearchK(http://possum.cbrc.jp/PoSSuM/search_k.html)メニューを開く。[PDB ID]テキストボックスに"1DJQ"を入力して、[HET code of ligand]テキストボックスに”ADP”を入力して、[Submit]ボタンを押す。
キーワードタンパク質 | 基質結合部位
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースPDB|CATH
主な対象データタンパク質-立体構造
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)6
最終更新日(調査日)2014/10/15 (2019/07/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクPDB(http://www.pdb.org/)|CATH(http://www.cathdb.info/)|School of Biological and Chemical Sciences(http://www.sbcs.qmul.ac.uk/)
論文等(PubMed ID)pmid:22113700 | pmid:22135290 | pmid:25404129
稼働状況稼働中