成果物名 PoSSuM
成果物の別名 Pocket Similarity Search using Multiple-Sketches
成果物に関する説明

タンパク質の類似リガンド結合部位データベース

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://possum.cbrc.jp/PoSSuM/
インターフェイス GUI
入力例

SearchK(http://possum.cbrc.jp/PoSSuM/search_k.html)メニューを開く。[PDB ID]テキストボックスに"1DJQ"を入力して、[HET code of ligand]テキストボックスに”ADP”を入力して、[Submit]ボタンを押す。

キーワード
タンパク質 基質結合部位
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0|なし
使っている外部リソース PDB|CATH
主な対象データ タンパク質-立体構造
生物種
全生物種
利用条件 なし
データ更新頻度 (過去2年間) 6
最終更新日(調査日) 2013/06/21 (2013/06/24)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 調査中
外部リンク

PDB(http://www.pdb.org/)|CATH(http://www.cathdb.info/)|School of Biological and Chemical Sciences(http://www.sbcs.qmul.ac.uk/)

論文等(PubMed ID)

pmid:22135290