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PMPj-Blast

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成果物名PMPj-Blast
成果物の別名なし
成果物に関する説明ミヤコグサやカンゾウのESTや完全長cDNA、 マイクロアレイプローブなど、PMPj(NEDO植物物質生産プロジェクト、H14?22)で得られた遺伝子配列情報をBlast検索することができるデータベース(出典:オリジナルサイトより)。
成果物のタイプDB
運用機関かずさDNA研究所
機関所在国日本
サイトURLhttp://webs2.kazusa.or.jp/IntegrationDBRS/pmpj-blast/
インターフェイスGUI
入力例サイトURL画面中央の[Arabidopsis cDNAチェックボックス]をオンにして、画面下部の[BLAST Search]ボタンをクリックする。
キーワードEST | cDNA | Contig | Design source of Probe | Probe Designed
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースTAIR
主な対象データDNA-配列 、EST-配列
生物種Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ]
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2011/00/00 (2019/07/02) 不明、既存日踏襲
利用できるIDSequence Name
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクTAIR(http://www.arabidopsis.org/)
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況稼働中