成果物名 MiFuP
成果物の別名 微生物遺伝子機能検索DB
成果物に関する説明

MiFuPはゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベースです。ゲノム配列が読まれている微生物について、その推定機能を収録しており、キーワード検索により、目的の機能を持つと推定される微生物を手軽に検索できます。機能検索では、微生物のゲノム配列、若しくはCDS配列を入力すると、その機能を推定できます。搭載しているMiFuP wikiでは、微生物が発揮する機能情報について、文献等から得られる情報(機能を発揮するメカニズム、実用化例等)を日本語でまとめ、記事ページを作成しています。

成果物のタイプ DB
運用機関 製品評価技術基盤機構
機関所在国 日本
サイトURL http://www.bio.nite.go.jp/mifup/
インターフェイス GUI
入力例

biosynthesis などのキーワードを入力してください

キーワード
調査中
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 調査中|個別データは、各エントリーページ(例 http://www.bio.nite.go.jp/mifup/genome/view/id/187)から取得
使っている外部リソース PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | eggNOG | GO | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MAIZEGDB | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | ProtClustDB | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway
主な対象データ アノテーション
生物種
微生物-細菌
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 2 times/year (予定)
最終更新日(調査日) 2015/04/02 (2018/04/17)
利用できるID
NRULE_ID | NFUNC_ID
IDを使った成果物の利用方法 http://www.bio.nite.go.jp/mifup/functions/view/id/[NFUNCID] | http://www.bio.nite.go.jp/mifup/ rules/view/id/[NRULEID]
外部リンク

PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | eggNOG | GO | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MAIZEGDB | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | ProtClustDB | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway

論文等(PubMed ID)

調査中