| 成果物名 | GenoBase |
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| 成果物の別名 | GenoBase |
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| 成果物に関する説明 | GenoBaseは大腸菌K-12(W3110)の生細胞システムを総合的に理解するためのデータベースである。GenoBaseは大腸菌に関する配列情報、プロテオーム、トランスクリプトーム、バイオインフォマティクス、文献に基づく知識の公共リポジトリである。NEDOプロジェクトの成果が一部含まれています。 |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | 奈良先端科学技術大学院大学 | パデュー大学 |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/genobase-v6/desc.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | [by keyword]JW No、ECK No、gene id、遺伝子名または 生物学的キーワードを入力して"Search"ボタンを押す。[by homology]DNA配列またはアミノ酸配列をテキストエリアに入力、相同性検索プログラムを選択して"Search"ボタンを押す。[CategoricalSearch]"ORF"、"RNA"、"Transcription"の各カテゴリーについて、DNA SIZE(bp)、Genomic region(bp)、Genomic region(min) のいずれかを選択し、ゲノム範囲を入力、"Search"ボタンを押す。[clip sequence]ゲノム位置を指定、またはDNA配列をテキストエリアに入力し、Convert(Clip/Convert)ボタンを押す。 |
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| キーワード | Escherichia coli K-12 (W3110) | Escherichia coli K-12 (MG1655) |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 20 (ゲノムデータ)|NA |
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| 使っている外部リソース | なし |
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| 主な対象データ | アノテーション |
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| 生物種 | Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 [Taxonomy_id: 511145, 大腸菌] | Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 [Taxonomy_id: 316407, 大腸菌] |
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| 利用条件 | 表示-継承 |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 1回/1年 |
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| 最終更新日（調査日） | 2009/01/00 (2019/07/02) 運用終了、アーカイブ化 |
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| 利用できるID | JW | ECK |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | なし |
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| 論文等（PubMed ID） | pmid:16738554 |
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| 稼働状況 | アーカイブ化 |
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