データベース

ProSeg

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成果物名ProSeg
成果物の別名タンパク質局所構造データベース
成果物に関する説明PrpSegは、タンパク質分子の部分構造を網羅的に分類、整理したデータベースです。7万以上のセグメントが主鎖の構造類似性にしたがって数千個程度のクラスタに分類されています。[出典]産総研プレスリリース(2008.4.5)http://unit.aist.go.jp/brf/brf-breed/ci/outputs/
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力例"ユーザーは任意の構造情報(PDB ID, dihedral angle, DSSP symbol)を入力することによって、最近接のクラスタを検索することが出来ます。"
キーワードタンパク質 | 部分構造
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法-|なし
使っている外部リソースPDB
主な対象データタンパク質-モチーフ
生物種全生物種
利用条件表示-非営利-改変禁止http://riodb.ibase.aist.go.jp/proseg/overview.html#FAQ12 を参照。
データ更新頻度 (過去2年間)2
最終更新日(調査日)2014/12/01 (2019/07/02)
利用できるIDPDB ID | Chain ID
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:18931918 | pmid:16731566
稼働状況運用終了