| 成果物名 | TMBETA-GENOME |
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| 成果物の別名 | Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins in Genomic Sequences. |
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| 成果物に関する説明 | TMBETA-GENOMEはゲノム配列が完了している生物種のゲノム中に含まれるβ?バレル型膜タンパク質のデータベースです。各ゲノム配列に対して、機械学習と統計手法を用いた計算が実行され、それらのアノテーション結果がデータベースに格納されています。その他、アミノ酸配列を入力してβ-バレル型膜タンパク質の判別解析を行う"TMBETA-DISC"や"TMBETA-SVM"などのツールも提供されています。 |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/tmbeta-genome/desc.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | Service タブを押して、左側のボックスで"organism name"を選択後、アノテーションの種類を選択して検索を実行。アミノ酸配列やその他の情報を入手可能。 |
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| キーワード | Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins | Machine learning |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 385|ダウンロード可能（開発者へお問い合わせください） |
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| 使っている外部リソース | NCBI | SWISS-PROT | SOSUI | PDB |
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| 主な対象データ | タンパク質-立体構造 |
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| 生物種 | 全生物種 |
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| 利用条件 | 表示-継承 |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | アーカイブ化済 |
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| 最終更新日（調査日） | 2015/12/11 (2019/07/04) 運用終了、アーカイブ化 |
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| 利用できるID | Genbank ID (gi) |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | NCBI |
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| 論文等（PubMed ID） | pmid:17088282 | pmid:15531602 | pmid:15833441 | pmid:15980447 | pmid:16204348 |
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| 稼働状況 | アーカイブ化 |
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