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MiFuP Safety

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成果物名MiFuP Safety
成果物の別名なし
成果物に関する説明微生物のゲノム情報から有害性に関わる遺伝子を検索し、微生物の有害性を推定するデータベースです。 微生物ゲノムの塩基配列又はアミノ酸配列を入力し検索すると、その配列中に有害性(毒素生産や薬剤耐性等)に関わる遺伝子領域が含まれていないか検出し、対象の微生物が有害性機能を有するかどうかを推定できます。
成果物のタイプDB
運用機関製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
機関所在国日本
サイトURLhttps://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/
インターフェイスGUI
入力例ゲノム塩基配列, CDS塩基配列, CDSアミノ酸配列で検索することができます
キーワード細菌 | 微生物 | ゲノム配列 | 微生物機能 | 病原因子
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.0|なし
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列 | アミノ酸配列 | アノテーション
生物種PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)随時
最終更新日(調査日)2021/10/26 (2021/11/10)
利用できるIDNFUNC_ID | NRULE_ID
IDを使った成果物の利用方法https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/functions/view/id/[NFUNC_ID]
https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/rules/view/id/[NRULE_ID]
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況稼働中