MiFuP Safety
成果物名 | MiFuP Safety |
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成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | 微生物のゲノム情報から有害性に関わる遺伝子を検索し、微生物の有害性を推定するデータベースです。 微生物ゲノムの塩基配列又はアミノ酸配列を入力し検索すると、その配列中に有害性(毒素生産や薬剤耐性等)に関わる遺伝子領域が含まれていないか検出し、対象の微生物が有害性機能を有するかどうかを推定できます。 |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/ |
インターフェイス | GUI |
入力例 | ゲノム塩基配列, CDS塩基配列, CDSアミノ酸配列で検索することができます |
キーワード | 細菌 | 微生物 | ゲノム配列 | 微生物機能 | 病原因子 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.0|なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | DNA-配列 | アミノ酸配列 | アノテーション |
生物種 | PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 随時 |
最終更新日(調査日) | 2021/10/26 (2021/11/10) |
利用できるID | NFUNC_ID | NRULE_ID |
IDを使った成果物の利用方法 | https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/functions/view/id/[NFUNC_ID] https://www.nite.go.jp/nbrc/mrinda/mifup_safety/rules/view/id/[NRULE_ID] |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | なし |
稼働状況 | 稼働中 |