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全ツールリスト

A Method for Extracting Optimal Sequence Related to Biological Activity

主な対象データ
DNA-モチーフ
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
全生物種
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ADMER2

主な対象データ
化合物 対象年のアメダスデータ(CD-ROM)、または、Version 2.5からは対象年のADMER専用アメダスデータ・・・気象データ作成に利用 * 対象化学物質の排出量に関するデータ(点源排出量、県別・市町村別排出量等) ・・・グリッド排出量データ作成に利用
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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ADMER3

主な対象データ
排出量と簡単な物性を入力データとして用意すれば、化学物質の大気中濃度と地表への沈着量の分布を、詳細な空間解像度(5kmから100m四方格子)で推定。
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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AIST-ICET

主な対象データ
化学物質
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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AIST-MeRAM

主な対象データ
化学物質
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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AIST-SHANEL

主な対象データ
気象データ、化学物質の排出量、基本的な物性(分子量、蒸気圧、水溶解度、Koc、半減期)
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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AIST‐CBAM

主な対象データ
化学物質
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
魚類
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ALN

主な対象データ
DNA配列、アミノ酸配列
運用機関
京都大学大学院 情報学研究科
生物種
全生物種
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ALNGG

主な対象データ
DNA-配列 、ゲノム
運用機関
京都大学大学院 情報学研究科
生物種
脊椎動物
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ASIAN

主な対象データ
遺伝子発現 プロファイル
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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BioDBScan

主な対象データ
遺伝子、パスウェイ、疾患など
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
ヒト、マウス、ラット、ホヤ
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CADLIVE

主な対象データ
代謝産物
運用機関
九州工業大学
生物種
全生物種
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CentroidAlifold

主な対象データ
RNA 二次構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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CentroidAlign

主な対象データ
RNA アラインメント
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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CentroidFold

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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CentroidHomfold

主な対象データ
二次構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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ChIP2LAMP

主な対象データ
DNA-配列 , RNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
全生物種
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CoCoozo

主な対象データ
タンパク質-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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COSMOS

主な対象データ
遺伝子
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
全生物種
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DAFS

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Dnemulator

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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DPClus

主な対象データ
タンパク質-機能
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
全生物種
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Dr DMASS

主な対象データ
マススペクトル
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
全生物種
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Dr DMASS+

主な対象データ
マススペクトル
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
全生物種
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fastapl

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Fdur

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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FORTE

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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FragmentAlign

主な対象データ
代謝産物 、マススペクトル
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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GeneDecoder

主な対象データ
DNA-配列 、真核生物の遺伝子
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
真核生物
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GPCRs Interaction Partners

主な対象データ
相互作用 GPCR
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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GRIFFIN

主な対象データ
タンパク質-配列 、アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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GRisk

主な対象データ
疾患リスク
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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GUPPY

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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HapRisk

主な対象データ
発現リスク
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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HEAT

主な対象データ
アノテーション
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒト
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HESS

主な対象データ
化合物 毒性情報
運用機関
製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ラット
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HomeoRoq

主な対象データ
タンパク質-アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
全生物種
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Idiographica

主な対象データ
染色体
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒト、マウス、ラット、ハエ
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ID一括変換システム

主な対象データ
データ識別子(ID)
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒト
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ID識別システム

主な対象データ
ID識別子
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒト、マウス、化合物データも含む
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IPknot

主な対象データ
RNA 偽結び目構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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KAGIANA

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
植物-シロイヌナズナ
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KaPPA-View

主な対象データ
代謝産物  遺伝子発現
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
植物-シロイヌナズナ、イネ、トマト、ミヤコグサ
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KaPPA-View4 KEGG

主な対象データ
代謝産物 パスウェイ
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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LAMP

主な対象データ
多重検定による統計的有意性
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
全生物種
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LAMPLINK

主な対象データ
DNA-配列 , RNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
全生物種
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LAST

主な対象データ
DNA-配列  RNA、タンパク質、ユーザー任意のアルファベット
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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MAFFT

主な対象データ
DNA-配列 アラインメント
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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MDV

主な対象データ
DNA-モチーフ
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
ヒト、マウスがサイト上で利用可能
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miRRim

主な対象データ
RNA  (miRNA)
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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MitoFates

主な対象データ
タンパク質-アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
菌類、植物、後生動物
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Murlet

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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MXSCARNA

主な対象データ
RNA  (RNA配列)
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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myPresto

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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NGSFeatGen

主な対象データ
DNA-配列 NGS
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PAPIA

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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paraclu

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PHMMTS

主な対象データ
RNA
運用機関
慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PMID-Extractor

主な対象データ
文献
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
なし
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POODLE

主な対象データ
タンパク質-アミノ酸特性
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PowerFT

主な対象データ
マススペクトルデータ
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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PRRN

主な対象データ
DNA配列、アミノ酸配列
運用機関
京都大学大学院 情報学研究科
生物種
全生物種
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PSTAG

主な対象データ
RNA
運用機関
慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PubMedScan

主な対象データ
PubMedに登録されている文献
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
なし
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Raccess

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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RactIP

主な対象データ
RNA RNA-RNA インタラクション
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Rchange

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
解説ページ →

Recount

主な対象データ
DNA-配列  次世代シーケンサーデータ
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Rentropy

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Rfold

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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RNAmine

主な対象データ
RNA RNA配列群
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター | みずほ情報総研株式会社
生物種
全生物種
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SAMURAI

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Scarna

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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SCARNA Local Multiple

主な対象データ
RNA アラインメント
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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ScreenCap3

主な対象データ
タンパク質-アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
生物種
後生動物
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seg-suite

主な対象データ
DNA-配列 , RNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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SGCAL

主な対象データ
糖鎖
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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siExplorer

主な対象データ
RNA siRNA
運用機関
東京大学大学院工学系研究科 化学生命工学専攻
生物種
ヒト
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SlideSort

主な対象データ
DNA-配列 タンパク質-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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SMARTS 3D

主な対象データ
タンパク質配列
運用機関
産業技術総合研究所 環境管理研究部門
生物種
なし
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SNP-system

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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SokanProject

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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SOKOS/CAN

主な対象データ
RNA  RNA配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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SPALN

主な対象データ
比較ゲノム
運用機関
京都大学大学院 情報学研究科
生物種
全生物種
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SpiceHIT

主な対象データ
代謝産物
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
解説ページ →

Stem Kernels

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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TACT

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒトヒト以外の41生物種(http://h-invitational.jp/tact/species.html)
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tantan

主な対象データ
DNA-配列 、RNA、 アミノ酸
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
解説ページ →

THE MICROARRAY ANALYSIS SYSTEM - TREBAX -

主な対象データ
遺伝子発現 マイクロアレイデータ
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
全生物種
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TMBETA-NET

主な対象データ
タンパク質-モチーフ
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
解説ページ →

toxRank

主な対象データ
化合物
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
人|ラット
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WoLF PSORT

主な対象データ
タンパク質-配列  真核生物の核ゲノムにコードされている蛋白質
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
真核生物
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Workflow

主な対象データ
ワークフロー
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
解説ページ →

タンパク質超二次構造のデータマイニング解析

主な対象データ
タンパク質立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 環境管理研究部門
生物種
なし
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リンク自動管理システム

主な対象データ
データ識別子(ID)
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
脊椎動物-哺乳類-ヒトマウス | ラット | ホヤ
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予測プログラム

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
広島大学
生物種
微生物-酵母
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教育用リスク評価ツール (公開保留(idb G1:2626))

主な対象データ
化合物
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
ヒト
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更新検知ツール

主な対象データ
Webページ
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
なし
解説ページ →

水系暴露解析モデル (公開保留 (idb G1:2626))

主な対象データ
化合物
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
不特定
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爆風の過圧・インパルス計算

主な対象データ
薬量、距離
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
なし
解説ページ →

発がん性予測システム

主な対象データ
化合物
運用機関
化学物質評価研究機構
生物種
ラット
解説ページ →