ツール

DAFS

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成果物名DAFS
成果物の別名なし
成果物に関する説明"期待精度最大化原理に基づいてRNA構造アラインメントを整数計画問題として定式化し,双対分解によってこれを高速に解くRNA配列アラインメントツールです。DAFSはFASTAフォーマットを入力として、構造アラインメントを出力します。"
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例FASTAフォーマットのファイルからアラインメントを作成するコマンドの例:> dafs RF00005:0.fa
キーワード期待精度最大化|双対分解
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件GPLv.3
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2013/03/22 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:23060618
稼働状況運用終了