データベース

SAHG

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成果物名SAHG
成果物の別名なし
成果物に関する説明ヒトゲノム予測構造・機能アノテーションの包括的なデータベースです。タンパク質をコードする全ORFが構造予測の対象です。このデータベースの開発ではJST(独立行政法人 科学技術振興機構)のサポートを受けています(出典:オリジナルサイト)。
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttps://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/sahg/desc.html
インターフェイスGUI
入力例トップページにある染色体図をクリック後に、タンパク質ドメインイメージ図をクリックする。
キーワード構造|ヒト|タンパク質|予測|blast|psi-blast|PPSW|P3A|FORTE|MODELLER
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースRefSeq|PDB|SCOP|HPRD|EzCatDB|KEGG
主な対象データタンパク質-立体構造
生物種ヒト
利用条件http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/sahg/lic.html
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2010/06/25 (2019/07/02)
利用できるIDRefSeq_ID
IDを使った成果物の利用方法http://bird.cbrc.jp/sahg/cgi-bin/detail.cgi?rid=[RefSeq_ID]&domain=0
外部リンクRefSeq(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/)|PDB(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)|SCOP(http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/)|HPRD(http://www.hprd.org/index_html)|EzCatDB(http://mbs.cbrc.jp/EzCatDB/)|KEGG(http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html)|Swiss-Prot(http://www.uniprot.org/)|InterPro(http://www.ebi.ac.uk/interpro/)
論文等(PubMed ID)pmid:21051360
稼働状況稼働中