ツール

CoCoozo

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成果物名CoCoozo
成果物の別名なし
成果物に関する説明CoCoozoはペプチド・タンデム質量分析向け並列高速サーチエンジンです。ピーク強度のパターンに相当するタンパク質配列を同定するために、MSスペクトルデータをクエリーとしてタンパク質配列データベースに対して高速な検索を行います。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例左部 "Search" タブより検索画面へ移動。入力ファイル(3種類のフォーマット)を指定し、パラメータを設定して"Submit"ボタンにより検索実行。
キーワードタンパク質
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースSwissProt | RefSeq
主な対象データタンパク質-配列
生物種全生物種
利用条件表示-改変禁止
データ更新頻度 (過去2年間)-
最終更新日(調査日)2011/04/18 (2019/07/05)
利用できるIDUniProt Accession Number | RefSeq ID
IDを使った成果物の利用方法-
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)-
稼働状況運用終了