ツール

CentroidFold

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成果物名CentroidFold
成果物の別名なし
成果物に関する説明CentroidFoldはRNAの2次構造予測および共通2次構造予測を行うためのソフトウェアです。ベンチマークテストではMfoldやRNAfoldよりも優れた予測性能を発揮することが確かめられています。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://rtools.cbrc.jp/
インターフェイスGUI
入力塩基配列(FASTAフォーマット)
出力"RNAの2次構造(テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット)"
入力例RNA配列を入力すると2次構造予測結果を表示する。RNA配列群を入力すると共通2次構造予測結果を表示する。
キーワードRNA | 共通2次構造 | 予測
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間)1
最終更新日(調査日)2018/07/05(2019/06/03)
利用できるID-
IDを使った成果物の利用方法適用なし
外部リンク-
論文等(PubMed ID)pmid:19095700 | pmid:19435882
稼働状況公開中