ツール

CentroidHomfold

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成果物名CentroidHomfold
成果物の別名なし
成果物に関する説明CentroidHomfoldは相同性配列を使ったRNAの2次構造予測を行います。ダウンロード版とWebサーバー版が提供されています。CentroidHomfoldはCentroidFoldのソフトウェアパッケージに含まれています。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://rtools.cbrc.jp/
インターフェイスCUI | GUI
入力塩基配列(FASTAフォーマット)
出力"RNAの2次構造(テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット)"
入力例centroid_homfold [options] input_seq(FASTA format)
キーワードRNA二次構造 | 相同性配列 | LAST | Centroifold
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データ二次構造
生物種全生物種
利用条件GPL
データ更新頻度 (過去2年間)1回以上/1年
最終更新日(調査日)2011/01/01 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:19478007
稼働状況公開中