ツール

Rentropy

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成果物名Rentropy
成果物の別名なし
成果物に関する説明Rentropyは、RNAの二次構造のボルツマン分布からエントロピーや、平均エネルギー、エネルギー変化を計算するツールです(出典:オリジナルサイトより翻訳) 。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例"run_rentropy.exe -outfile=rentropy_out.txt -command=compute_ent_subseq -seqfile=seqs.fa-max_span=200 -length_set=100,200(ダウンロードファイルに引数で指定しているファイルと実行方法が記載されています) "
キーワードエントロピー|RNA二次構造|ボルツマン分布
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0回/年
最終更新日(調査日)2011/00/00 (2019/07/08)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)Hisanori Kiryu and Kiyoshi Asai.R-entropy: An algorithm for computing thermodynamic entropy of RNA secondary structures.(submitted)
稼働状況運用終了