ツール

Rchange

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成果物名Rchange
成果物の別名なし
成果物に関する説明Rchangeは塩基置換おけるRNA二次構造のエネルギー変化を計算するツールです(出典:オリジナルサイトより翻訳)。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://rtools.cbrc.jp/
インターフェイスCUI
入力塩基配列(FASTAフォーマット)
出力"二次構造のエネルギー変化(テキスト、PDF,PNG,EPS)"
入力例run_rchange -outfile=rchange_out.txt -command=compute_mut1 -seqfile=seqs.fa -max_span=200 -max_mut2_span=10 (ダウンロードファイルに引数で指定しているファイルと実行方法が記載されています)
キーワードアルゴリズム|塩基置換|RNA二次構造|エネルギー変化
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0回/年
最終更新日(調査日)2011/00/00 (2019/07/09)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:22373787
稼働状況公開中