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LAMPLINK

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成果物名LAMPLINK
成果物の別名detection of statistically significant epistatic interactions
成果物に関する説明LAMPLINKはGWASデータから2つ以上のSNPsの統計的有意性のあるエピスタシス相互作用を検出することができる。広く知られたGWAS解析ソフトであるPLINKと同じ方法である。LAMPLINKは多重仮説検証を行うLANPを用いてエピスタシス相互作用を検出するオプションを追加したものである。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
機関所在国日本
サイトURLhttp://a-terada.github.io/lamplink/
インターフェイスCUI
入力SNPデータ(MAP,PEDフォーマット)
出力統計解析結果(テキスト(TSV))
入力例サイト画面にてGWASデータセットを用いた結果が示されている。
キーワード
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法105|https://github.com/a-terada/lamplink/archive/master.zip
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列 , RNA-配列
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)不明
最終更新日(調査日)2017/05/19 (2019/06/03)
利用できるIDなし
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)PMID:23882073 | PMID:17701901
稼働状況公開中