ツール

SokanProject

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成果物名SokanProject
成果物の別名なし
成果物に関する説明数値の行列データファイルから、パラメータを設定してPearson積率相関係数を総当たりで計算してテキストファイルに出力するJavaソフトウェアです。複数のマイクロアレイデータやノンターゲットメタボローム解析データなどの大規模な行列データセットから、遺伝子間の共発現性相関または代謝物ピーク間の共蓄積性相関などを計算することができます。得られた出力ファイルは、他のプログラムやスクリプトを用いることで、特定の遺伝子や代謝物と関係ある遺伝子または代謝物候補をスクリーニングしたり、遺伝子または代謝物の相関ネットワーク解析を行ったりするために使うことができます。また、スモールスケールの実験結果であっても同様にプログラムを適用できます。
成果物のタイプTool
運用機関かずさDNA研究所
機関所在国日本
サイトURLhttp://www.kazusa.or.jp/komics/ja/tool-ja/34-sokanproject.html
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例「Select File」でファイル(データ行列)を選択し、出力する係数範囲を指定した後、「Start」ボタンを押すと、処理が開始され、結果がファイルに出力されます。
キーワードピアソン相関係数 | DNAマイクロアレイ | 共発現性
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.42|http://www.kazusa.or.jp/komics/images/komics/tool/SokanProject/SokanProject.zipをダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データ遺伝子発現
生物種全生物種
利用条件本ソフトウェアはアカデミックフリーです。商用利用は認めておりません。
データ更新頻度 (過去2年間)0回
最終更新日(調査日)2005/07/00 (2019/07/09)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況公開中