ツール

MAFFT

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成果物名MAFFT
成果物の別名Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
成果物に関する説明MAFFTはUNIX系OSで稼働する多重アラインメントプログラムです。このプログラムはL-INS-iやFFT-NS-2などの範囲で多重アラインメント法が利用できます。ダウンロード版(MacOS X用、Windows用、Linux用、Sourceファイル)とオンライン版を提供しています。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
インターフェイスGUI | CUI
入力塩基 もしくは アミノ酸配列(FASTAフォーマット)
出力
入力例多重アラインメント作成では次の様に入力する:mafft [options] input_seq (FASTA format) > output_seq
キーワード多重アラインメント | L-INS-i | FFT-NS-2
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法15.8|http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ からファイルダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列 アラインメント
生物種全生物種
利用条件GPL
データ更新頻度 (過去2年間)29
最終更新日(調査日)2019/05/00 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:23329690 | pmid:23023983 | pmid:20427515 | pmid:19378139 | pmid:18439255 | pmid:18372315 | pmid:17118958 | pmid:15661851 | pmid:12136088 | pmid:23329690
稼働状況公開中