ツール

seg-suite

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成果物名seg-suite
成果物の別名なし
成果物に関する説明"配列セグメントの交差や配列アラインメントの合成を行うツールです。このツールでは「seg」フォーマットを利用できます。また、様々なデータフォーマットを「seg」フォーマットに変換する事ができます。"
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例さまざまなデータフォーマットから、セグメントやアラインメントを作成する例:seg-import maf myAlignments.maf > myAlignments.seg
キーワードアラインメント|セグメント
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.1|http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/seg-suite-11.zip からソフトウェアをダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データ"DNA-配列 , RNA-配列"
生物種全生物種
利用条件GPLv3
データ更新頻度 (過去2年間)1
最終更新日(調査日)2014/01/14 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況公開中