ツール

seg-suite

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成果物名seg-suite
成果物の別名なし
成果物に関する説明配列セグメントの交差や配列アラインメントの合成を行うツールです。このツールでは「seg」フォーマットを利用できます。また、様々なデータフォーマットを「seg」フォーマットに変換する事ができます。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例さまざまなデータフォーマットから、セグメントやアラインメントを作成する例:seg-import maf myAlignments.maf > myAlignments.seg
キーワードアラインメント|セグメント
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.1|http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/seg-suite-11.zip からソフトウェアをダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列 , RNA-配列
生物種全生物種
利用条件GPLv3
データ更新頻度 (過去2年間)1
最終更新日(調査日)2014/01/14 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況公開中