1. ホーム
  2. データベース

その他

MEDALS

noimage
要約このサイトです。経済産業省関連機関により実施されたライフサイエンス分野の研究開発プロジェクトの成果であるデータベースやツ?ルに関する情報提供サイトです。
主な対象データメタデータ
解説ページ →

mFAERS

noimage
要約mFAERSでは、厚労省指定難病とFDA Adverse Event Reporting System (FAERS)に報告されている薬剤や副作用情報を連携して提供しています。FAERS とはアメリカ食品医薬品局(FDA)において運用されている医薬品の有害事象(副作用)レポートシステムです。本システムはFAERS の公開データをデータベース化しており、医薬品名、疾患名、副作用名による検索を提供します。また、医薬品と副作用の関連をスコア付けし、表示します。
主な対象データ医薬品の有害事象
解説ページ →

MFSearcher

noimage
要約精密質量値から予測される組成式を高速に推定することができるWeb serviceです。 既存の化合物データベースに対する質量値からの検索も高速に行えます(出典:オリジナルサイトより)。
主な対象データ化合物
解説ページ →

MS-MS Fragment Viewer

noimage
要約MS-MS Fragment ViewerはLC-FT/ICR-MS解析で得たフラグメントイオンの構造を予測したFT-MS、IT-MS/MS、FT-MS/MSのスペクトルデータを格納したメタボロミクスデータベースです(出典:オリジナルサイトより)。
主な対象データ化合物 、マススペクトル
解説ページ →

Multi-view Fractal DataBase

noimage
要約多視点画像認識は、物体操作、移動ロボット サービス、ナビゲーション ロボットなどのロボティクス アプリケーションで弱い視点を残さないようにするためのソリューションの 1 つです。たとえば、家庭内の移動ロボットは、家事を行うために、与えられた画像でオブジェクトのカテゴリと姿勢を判断する必要があります。この論文では、数式駆動型教師あり学習 (FDSL) に基づく自動マルチビュー データセット構築の方法を提案しています。 3D オブジェクトのデータ収集と人間による注釈付けは明らかに労働集約的ですが、提案されたマルチビュー データセットで 3D モデル、マルチビュー画像、およびそれらのトレーニング ラベルを同時に自動的に生成します。大規模なマルチビュー データセットを作成するために、現実世界の多くのオブジェクトの背景情報と見なされるフラクタル ジオメトリを使用します。この現実世界の背景知識により、畳み込みニューラル ネットワーク (CNN) は、任意のビューの画像認識に関してより優れた表現を取得できるようになると期待されています。レンダリングされた 3D フラクタル モデルから円形に投影して、マルチビュー フラクタル データベース (MV-FractalDB) を構築します。これを使用して、事前にトレーニングされた CNN モデルを作成し、マルチビュー画像認識の問題を改善します。データセットの構築は自動であるため、当社の MV-FractalDB を使用する場合、事前トレーニング段階で 3D モデルの定義や追加の手動注釈は必要ありません。実験結果によると、MV-FractalDB の事前トレーニング済みモデルは、自己教師ありメソッド (SimCLR や MoCo など) の精度を上回り、パフォーマンス レートの点で教師ありメソッド (ImageNet 事前トレーニング済みモデルなど) に近いです。マルチビュー画像データセット。また、MV-FractalDB の事前トレーニング済みモデルは、ModelNet40 データセットの ImageNet 事前トレーニング済みモデルよりも収束速度が優れていることが確認されました。さらに、FDSL を使用した多視点画像認識の可能性を示します。
主な対象データ静止画
解説ページ →

NBRC (Biological Resource Center, NITE)

noimage
要約独立行政法人 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター:NBRC (NITE Biological Resource Center)は、生物資源センターとして、糸状菌、酵母、細菌、放線菌、微細藻類など約9万株を収集・保存し、基礎研究から産業利用まで幅広い用途に提供しています。
主な対象データ各種データ
解説ページ →

NBRCオンラインカタログ検索

noimage
要約NBRC (NITE Biological Resource Center)は、バイオ産業の発展のため、糸状菌、酵母、細菌、放線菌、微細藻類など多様な微生物資源を収集・保存し、提供しています。本サイトでは、試験及び研究開発を行う企業・大学等が、これら資源の検索と詳細情報を確認することができます。
主な対象データDNA-配列
解説ページ →

NITE-CHRIP

noimage
要約化学物質の番号や名称等から、有害性情報、法規制情報及び国内外の機関による有害性情報、リスク評価情報等を検索することができるシステムです。
主な対象データ化合物 化学物質
解説ページ →

OpenPML

noimage
要約今日の生物科学分野では、遺伝子多様性と表現多型の相関性に関する研究はキーになるテーマです。多くの協力者および研究者の間で共有される必要がある膨大な量のデータを生成する大規模な数の研究を牽引しています。この様なデータを格納し効率的に利用する為に、それは生物医学研究者が互換性を担保し同様の方法でデータを記述する事は最も重要です。JBiCはPaGE-OM(Phenotype and Genotype-Object Model)を開発し、既存のさまざまな表現型や遺伝子をデータベースに適用することによってPaGE-OMを検証し、どのようにして更にデータベースをPaGE-OMで表現できるかをデモしています(出典:オリジナルサイトより)。オリジナルサイト(http://www.openpml.org/)は運用停止しており、NBDCでアーカイブサイトを公開中 ( http://dbarchive.biosciencedbc.jp/archive/openpml/ )。
主な対象データDNA-多型
解説ページ →

PoSSuM

noimage
要約タンパク質の類似リガンド結合部位データベース
主な対象データタンパク質-立体構造
解説ページ →