PPI view
| 要約 | PPI viewは、ヒトのタンパク質間相互作用 (PPI:Protein-Protein Interaction)情報を表示しています。主要な５つのPPIデータベース(BIND, DIP, MINT, HPRD, IntAct)から、データの収集・統合を行い、H-InvDBの独自予測されたタンパク質についてPPIの割り当てを行いました。その結果、9,268件のタンパク質からなる32,198件のヒトのタンパク質間相互作用情報が得られました。 (H-InvDB version 5.0時点)PPI viewはユーザーの興味あるタンパク質(遺伝子産物)と相互作用するタンパク質を表示し、そのタンパク質の遺伝子の位置(Locus view)や遺伝子の機能情報(cDNA view)へのリンク、そしてデータ元PPIデータベースへの参照情報や、文献、実験手法を表示します。PPI view: http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/ PPI view サンプル画面:http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/ppi_view.cgi?hip=HIP000084307 |
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| 主な対象データ | タンパク質-プロテオーム |
Properties Data base
| 要約 | 本データベースは、熱関連材料および基本的物質について、物性データ(標準生成エンタルピー、標準生成ギブスエネルギー、標準エントロピー、比熱容量、転移エンタルピー、転移エントロピー)を収録しております。 |
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| 主な対象データ | 熱関連材料 | 基本的物質 |
PRTRマップは排出量マップと濃度マップ
| 要約 | PRTRマップは排出量マップと濃度マップで構成されており、排出量マップは、 国が公表した平成14年度から平成30年度（平成13年度から平成29年度把握）までのPRTR届出データの排出量を、 縮尺に応じて都道府県単位または市区町村単位（自治体単位）または町名単位で色分け表示しています。 濃度マップは、 平成14年度から平成30年度（平成13年度から平成29年度把握）までの日本全国の化学物質の 年間日平均の 大気中推定濃度を、５倍メッシュ（5km×5km）（縮尺1/20万以上では３次メッシュ（1km×1km※））の メッシュごとに濃度に応じて色分け表示しています。 大気中推定濃度は、 国が公表した平成14年度から平成30年度（平成13年度から平成29年度把握）までのPRTR届出データの排出量と PRTR届出外データの 排出量（すそ切り以下事業者、PRTR非対象業種事業者、移動体及び家庭からの排出量）を合計したメッシュごとの排出量データの他、 年間気象データ等を基データとして、独立行政法人産業技術総合研究所で開発されたAIST-ADMERで計算しています。 （平成25年度までの推計はAIST-ADMER Ver,2.6を平成26年度からはAIST-ADMER Ver,3.0を使用） ※ 1km×1kmのメッシュで表示されるのは、平成22年度以降のPRTRデータに基づく推定値です。PRTRマップで公開している排出量（事業所、3次メッシュ、5倍メッシュ）、大気中推定濃度（3次メッシュ、5倍メッシュ）、 AIST-ADMER計算用入力データは、こちらからダウンロードが可能です。 |
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| 主な対象データ | 排出量データ | 濃度データ |
RISCAD
| 要約 | リレーショナル化学災害データベース：当データベースは、事故が多発している煙火原料、組成物の安全情報を整備・公開し、 化学物質の爆発安全にかかわる情報（物性、評価法、過去の事例、予測法など）を網羅的に調べることができるような、百科事典的データベースの作成を目的とし、様々な産業や研究活動における安全性向上に少しでも寄与することを目指して作製しています。 |
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| 主な対象データ | 化学災害事例 ｜化学物質 |
Rminfo
| 要約 | RMinfoは、国立研究開発法人産業技術総合研究所の計量標準総合センター（NMIJ）が運営している標準物質の紹介サイトです。日本国内の機関が供給している約8,000の認証標準物質（CRM）及び標準物質（RM）が登録されています。 |
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| 主な対象データ | 標準物質 |
RnR
| 要約 | RnRはT87培養細胞における遺伝子転写や蓄積する代謝産物の予測データベースです。このデータベースは214のDNAマイクロアレイと222のGC-MS、202のUPLC-MSアッセイをベースにしています。（オリジナルサイトから） |
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| 主な対象データ | 代謝産物 |
TOT-DB
| 要約 | TOT-DB (The Theileria orientalis Genome Annotation Database)は、寄生性原虫タイレリア・オリエンタリスの遺伝子と転写産物を対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。ゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同検索やデータの一括ダウンロードも行えます。 |
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| 主な対象データ | 比較ゲノム |
toxBridge
| 要約 | toxBridgeは肝毒性in vivo/vitroブリッジングに着眼したデータベースである。公開データベースOpen TG-GATEsに登録されている約170の化合物によるラットin vivo（肝臓）/vitro（肝細胞）及びヒトin vitro（肝細胞）の遺伝子発現データの大規模数理解析を行った。本研究では、肝毒性を予測するためのマーカー群としてのパネル構築を目的として、化合物種、暴露期間、暴露量ごとに遺伝子刻印およびそのパスウェイを推定し、また4種の肝毒性に関する生理的指標についても整理を行い、体系的にデータベース（toxBridge）に収納した。toxBridgeの特徴としては、in vivo - in vitroやin vitroヒト-ラット間のブリッジングに着眼し、発現プロファイルのブリッジ間における様々な相関指標をデータベースに格納しており、各種相関指標による化合物検索や遺伝子・パスウェイを検索する機能を有している点である。この機能により、相関指標を用いてどの化合物がブリッジングとして有意であるか、また相関指標が優位である化合物を選択することでブリッジングにおける分子群を選択し可視化可能としている。加えて既存情報であるFDAが公開しているDILI （Drug Induced Liver Injury）Rankを用い化合物を選択し、相関指標を用いることで肝毒性におけるマーカー群となりうる分子パネルの選定を可能としている。 |
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| 主な対象データ | ラット｜人｜in vivo | in vitro |
