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全データベースリスト

ARTRA

主な対象データ
遺伝子発現 マイクロアレイ
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
植物-シロイヌナズナ
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ASTRA

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ]
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ATTED II

主な対象データ
遺伝子発現 、マイクロアレイ、パスウェイ
運用機関
東北大学 | 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
生物種
Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
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CellMontage

主な対象データ
遺伝子発現 | 細胞 | 組織
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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CELLPEDIA

主な対象データ
細胞
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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CGH Data Base

主な対象データ
病気-ガン
運用機関
東京医科歯科大学 難治疾患研究所
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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ConfC

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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CoP

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Arabidopsis thaliana | Glycine max | Hordeum vulgare | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Glycine max [Taxonomy_id: 3847, ダイズ] | Hordeum vulgare [Taxonomy_id: 4513, オオムギ] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Populus trichocarpa [Taxonomy_id: 3694, コットンウッド] | Triticum aestivum [Taxonomy_id: 4565, コムギ] | Vitis vinifera [Taxonomy_id: 29760, ブドウ] | Zea mays [Taxonomy_id: 4577, トウモロコシ]
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COVID-19症例データベース

主な対象データ
COVID19の症例
運用機関
自治医科大学
生物種
ヒト
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DAGViz

主な対象データ
アノテーション GO
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Agrobacterium tumefaciens str. C58 | Anaplasma phagocytophilum HZ | Arabidopsis thaliana | Agrobacterium tumefaciens str. C58 [Taxonomy_id: 176299, アグロバクテリウム・ツメファシエンス] | Anaplasma phagocytophilum HZ [Taxonomy_id: 212042, アナプラズマ・ファゴサイトフィルム] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Bacillus anthracis str. Ames [Taxonomy_id: 198094, 炭疽菌] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Campylobacter jejuni RM1221 [Taxonomy_id: 195099, カンピロバクター・ジェジュニ] | Candida albicans [Taxonomy_id: 5476, カンジダ・アルビカンス] | Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 [Taxonomy_id: 246194, カーボキシドサーマス・ハイドロゲノフォルマンス] | Clostridium perfringens ATCC 13124 [Taxonomy_id: 195103, ウェルシュ菌] | Colwellia psychrerythraea 34H [Taxonomy_id: 167879, コルウェリア・サイクレリスラエ] | Coxiella burnetii RSA 493 [Taxonomy_id: 227377, Q熱コクシエラ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Dehalococcoides ethenogenes 195 [Taxonomy_id: 243164] | Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Ehrlichia chaffeensis Arkansas [Taxonomy_id: 205920, エーリキア・シャフェンシス] | Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Geobacter sulfurreducens PCA [Taxonomy_id: 243231, ゲオバクター・スルフレデュセンス] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Hyphomonas neptunium ATCC 15444 [Taxonomy_id: 228405, ハイフォモナス・ネプチュニウム] | Leishmania major [Taxonomy_id: 5664, 森林型熱帯リーシュマニア] | Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 [Taxonomy_id: 265669, リステリア菌] | Magnaporthe grisea [Taxonomy_id: 148305, イネいもち病菌] | Methylococcus capsulatus str. Bath [Taxonomy_id: 243233, メチロコッカス・カプスラタス] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Neorickettsia sennetsu str. Miyayama [Taxonomy_id: 222891, ネオリケッチア・センネツ] | Oomycetes [Taxonomy_id: 4762, 卵菌] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Plasmodium falciparum [Taxonomy_id: 5833, 熱帯熱マラリア原虫] | Pseudomonas aeruginosa PAO1 [Taxonomy_id: 208964, 緑膿菌] | Pseudomonas fluorescens Pf-5 [Taxonomy_id: 220664, 蛍光菌] | Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A [Taxonomy_id: 264730, シリンゲ菌] | Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 [Taxonomy_id: 223283, シリンゲ菌] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Schizosaccharomyces pombe [Taxonomy_id: 4896, 分裂酵母] | Shewanella oneidensis MR-1 [Taxonomy_id: 211586, シェワネラ・オネイデンシス] | Silicibacter pomeroyi DSS-3 [Taxonomy_id: 246200, サイリシバクター・ポメロイ] | Solanaceae [Taxonomy_id: 4070, ナス科] | Trypanosoma brucei [Taxonomy_id: 5691, ブルセイトリパノソーマ] | Vibrio cholerae [Taxonomy_id: 666, コレラ菌]
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