プロジェクト

科研費 (208059)

プロジェクト名科研費 (208059)
分野ゲノムインフォマティックス
目的　生物学的な知見を得るためGPCR遺伝子を全て保有し、それらの機能情報を網羅的に解析することが必要とされるが、現状の生化学実験ではコストと時間がかかり不可能である。バイオインフォマテイクス手法で、実験を支援できるような研究成果を国際的にも、国内でも流通させるため国内でデータベース化することを目的としている。
紹介 本事業では、バイオインフォマティクス手法を応用し真核生物のゲノム配列からGPCR遺伝子を網羅的に同定し、生物種、染色体番号、ゲノム上の座標、タンパク質の機能情報を収納し、視覚的なインターフェイスで表現した総合ＤＢを作成している。　実験で発現が確認されずとも、ゲノム上に存在し発現可能性のある遺伝子を全て含むのが大きな特徴で、GPCRの総合的な理解やGPCR関連創薬に大きく貢献できる可能性が高い。　従来から構築しているＳＥＶＥＮＳではデータの収集、評価およびＤＢ化のための作成組織と、技術的方式は既に確立しているので今後、機能解析・予測情報をさらに充実させて、アクセス数を伸ばすことにより、世界的なＤＢとして定着させることを目的とする。
キーワードＧＰＣＲ｜Genome|Function|annotation|
開始-終了年度2007-2008
代表者諏訪牧子
代表者所属組織産業技術総合研究所　生命情報工学研究センター
予算5
代表委託機関なし
参加機関なし
報告書
特許（日本、海外）
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