Idiographica
| 要約 | Idiographicaは、自分用のイデオグラムを作成するウェブサーバーです。ウェブ入力フォームに情報を入力してから、submitボタンをクリックしてください。ldiographicaサーバーからあなたにイデオグラム作成完了をお知らせするメールが届きます。イデオグラムは如何なる制約や義務も必要と致しません。（オリジナルサイトから翻訳） |
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| 主な対象データ | 染色体 |
LAMPLINK
| 要約 | LAMPLINKはGWASデータから２つ以上のSNPsの統計的有意性のあるエピスタシス相互作用を検出することができる。広く知られたGWAS解析ソフトであるPLINKと同じ方法である。LAMPLINKは多重仮説検証を行うLANPを用いてエピスタシス相互作用を検出するオプションを追加したものである。 |
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| 主な対象データ | DNA-配列 , RNA-配列 |
LAST
| 要約 | DNAやタンパク質の配列アライメントを作成し、比較する大規模ゲノム配列比較ツールです。BLASTに似ていますが、大量のデータを扱うのに適しています。 |
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| 主な対象データ | DNA-配列 RNA、タンパク質、ユーザー任意のアルファベット |
MAFFT
| 要約 | MAFFTはUNIX系OSで稼働する多重アラインメントプログラムです。このプログラムはL-INS-iやFFT-NS-2などの範囲で多重アラインメント法が利用できます。ダウンロード版（MacOS X用、Windows用、Linux用、Sourceファイル）とオンライン版を提供しています。（オリジナルサイトから翻訳） |
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| 主な対象データ | DNA-配列 アラインメント |
miRRim
| 要約 | miRRimは隠れマルコフモデル（HMM）をベースとしたmiRNA遺伝子の予測ツールです。このツールでは、miRNAの進化的、二次構造の特徴が多次元ベクトルシーケンスで表現されています。HMMsは配列の連続値を計算し、ベクトルシーケンスに利用されるモデルです。（オリジナルサイトから翻訳） |
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| 主な対象データ | RNA (miRNA) |
Murlet
| 要約 | MurletはSankoffアルゴリズムにもとづきRNAのマルチプルアライメントを高速かつ低メモリに作成するプログラムです。産業技術総合研究所の生命情報工学研究センターで開発されました。 |
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| 主な対象データ | RNA |
MXSCARNA
| 要約 | RNA配列のマルチプルアラインメントツールです。それぞれのRNA配列の塩基対確率行列を用いて、配列群の共通二次構造を考慮してアラインメントします。 |
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| 主な対象データ | RNA （RNA配列） |
