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SEVENS

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成果物名SEVENS
成果物の別名なし
成果物に関する説明GPCR遺伝子の網羅的データベースです。7本膜貫通ヘリックス型タンパク質のGPCR遺伝子を網羅的に収めたデータベースです。32の真核生物のゲノムからバイオインフォマティクス手法で、遺伝子を高精度に同定しています。
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://sevens.cbrc.jp/
インターフェイスGUI
入力例生物種を選択し、キーワードを検索テキストボックスに入力、[submit]ボタンを押します。Chromosome Number、Exon Number、Protein Length、Pseudogene、Familyを選択可能です。
キーワードGPCR (G-protein coupled receptor) | Odorant/olfactory and gustatory receptors | Chemokines and chemotactic factors receptors | taste receptors | metabotropic glutamate and calcium receptors | Insect chemosensory receptors | Opsins | Nematode chemoreceptors | Serpentine receptor-like proteins | Sre proteins | Plant MLO receptors | slime mold receptors | Archaeal/bacterial/fungal opsin family | fungal receptors | BLAST | SOSUI | ALN | HMMER | Anopheles gambiae (マラリア媒介蚊) | Saccharomyces cerevisiae (清酒酵母)
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法"7,000|現在一括ダウンロード不可。"
使っている外部リソースNCBI | KEGG | SWISS-Prot | Pfam
主な対象データタンパク質-配列 アミノ酸配列
生物種"Homo sapiens | Pan troglodytes | Gorilla gorilla | Anolis carolinensis [Taxonomy_id: 28377, ミドリアノール] | Anopheles gambiae [Taxonomy_id: 7165, ガンビアハマダラカ] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Caenorhabditis brenneri [Taxonomy_id: 135651] | Caenorhabditis briggsae [Taxonomy_id: 6238, 線虫] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Caenorhabditis remanei [Taxonomy_id: 31234] | Callithrix jacchus [Taxonomy_id: 9483, マーモセット] | Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ] | Cavia porcellus [Taxonomy_id: 10141, モルモット] | Ciona intestinalis [Taxonomy_id: 7719, ユウレイボヤ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Dasypus novemcinctus [Taxonomy_id: 9361, ココノオビアルマジロ] | Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Drosophila simulans [Taxonomy_id: 7240, オナジショウジョウバエ] | Drosophila yakuba [Taxonomy_id: 7245, ヤクバショウジョウバエ] | Echinops telfairi [Taxonomy_id: 9371, ヒメハリテンレック] | Erinaceus europaeus [Taxonomy_id: 9365, ナミハリネズミ | ヨーロッパハリネズミ] | Felis catus [Taxonomy_id: 9685, ネコ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Gasterosteus aculeatus [Taxonomy_id: 69293, イトヨ] | Gorilla gorilla [Taxonomy_id: 9593, ゴリラ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Loxodonta africana [Taxonomy_id: 9785, アフリカゾウ] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Macropus eugenii [Taxonomy_id: 9315, ダマヤブワラビー] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Myotis lucifugus [Taxonomy_id: 59463, トビイロホオヒゲコウモリ] | Ochotona princeps [Taxonomy_id: 9978, アメリカナキウサギ] | Ornithorhynchus anatinus [Taxonomy_id: 9258, カモノハシ] | Oryctolagus cuniculus [Taxonomy_id: 9986, ウサギ] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Otolemur garnettii [Taxonomy_id: 30611, ガーネットガラゴ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Papio hamadryas [Taxonomy_id: 9557, マントヒヒ] | Petromyzon marinus [Taxonomy_id: 7757, ヤツメウナギ] | Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン] | Procavia capensis [Taxonomy_id: 9813, イワダヌキ | ケープハイラックス] | Pteropus vampyrus [Taxonomy_id: 132908, ジャワオオコウモリ] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Sorex araneus [Taxonomy_id: 42254, ヨーロッパトガリネズミ] | Spermophilus tridecemlineatus [Taxonomy_id: 43179, ジュウサンセンジリス] | Taeniopygia guttata [Taxonomy_id: 59729, キンカチョウ] | Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ] | Tarsius syrichta [Taxonomy_id: 9478, フィリピンメガネザル] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883] | Tupaia belangeri [Taxonomy_id: 37347] | Tursiops truncatus [Taxonomy_id: 9739, バンドウイルカ] | Vicugna pacos [Taxonomy_id: 30538] | Xenopus tropicalis [Taxonomy_id: 8364, ゼノパス・トロピカリス]"
利用条件表示-非営利-継承アカウント不必要
データ更新頻度 (過去2年間)2
最終更新日(調査日)2014/12/05 (2019/07/03)
利用できるIDCBRC-species-2digit numbers-4digit numbers
IDを使った成果物の利用方法EA-UM1Vdetail.php?db=[生物種]&chr=[染色体番号]&l=1&r=1053750&twin=0&id=[ID]
外部リンク"ExPASy Proteomics Server(http://www.expasy.org/), NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), Pfam(http://pfam.sanger.ac.uk/)"
論文等(PubMed ID)pmid:16126348 | pmid:19718507
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