データベース

HGPD

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成果物名HGPD
成果物の別名Human Gene and Protein Database
成果物に関する説明HGPDはヒトゲートウェイクローンやタンパク発現データ、細胞内局在を格納し、これらクローンを検索できるユニークなデータベースです。NEDOの完全長cDNAプロジェクトで、30000件のヒトcDNAクローン配列を解析しました。(論文からhttp://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/gkn872?ijkey=zKpNqhZH6jrUuzi&keytype=ref)
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttps://hupex.hgpd.jp/entrance/index.html
インターフェイスGUI
入力例1.サイトURL画面の上部検索テキストボックスに"AK092682"を入力して、[submit]ボタンを押してください。
キーワードFLJ cDNAs | Gateway Entry Clones | Protein Analysis Data | Subcellular Localizaiton
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法48|http://hgpd.lifesciencedb.jp/sys_info/download.html からファイルダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列
生物種"Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]"
利用条件https://hupex.hgpd.jp/hgpd/mta/License%20No19.pdf
データ更新頻度 (過去2年間)7
最終更新日(調査日)2016/10/26 (2019/07/02)
利用できるIDAccession Number | Sequence ID
IDを使った成果物の利用方法http://hgpd.lifesciencedb.jp/SVDB_v05/cgi/sv_cdna_info.cgi?cdna=C-SKMUS2000679
外部リンクNCBI | DDBJ | FLJ Human cDNA Database | FLJ-DB | H-Inv DB | NEDO | HUGE | MGC | The German Human cDNA Project | UniGene | CGAP | SAGE | TIGR Gene Indices | STACK | BODYMAP | NITE | AIST | Japan Biological Informatics Consortium | Research Association for Biotechnology | Reverse Proteomics Research Institute
論文等(PubMed ID)pmid:19054851 | pmid:19073703 | pmid:22140100
稼働状況稼働中