＜前へ
次へ＞
MiFuP
| 成果物名 | MiFuP |
|---|---|
| 成果物の別名 | 微生物遺伝子機能検索DB |
| 成果物に関する説明 | MiFuPはゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベースです。ゲノム配列が読まれている微生物について、その推定機能を収録しており、キーワード検索により、目的の機能を持つと推定される微生物を手軽に検索できます。機能検索では、微生物のゲノム配列、若しくはCDS配列を入力すると、その機能を推定できます。搭載しているMiFuP wikiでは、微生物が発揮する機能情報について、文献等から得られる情報（機能を発揮するメカニズム、実用化例等）を日本語でまとめ、記事ページを作成しています。 |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | https://www.nite.go.jp/nbrc/mifup/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | biosynthesis などのキーワードを入力してください |
| キーワード | 細菌 | 微生物 | ゲノム配列 | 微生物機能 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0|なし |
| 使っている外部リソース | PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | eggNOG | GO | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | ProtClustDB | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway |
| 主な対象データ | DNA-配列 | アミノ酸配列 | アノテーション |
| 生物種 | 微生物-細菌 |
| 利用条件 | 表示-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 随時 |
| 最終更新日（調査日） | 2021/10/26 (2021/11/8) |
| 利用できるID | NRULE_ID | NFUNC_ID |
| IDを使った成果物の利用方法 | https://www.nite.go.jp/nbrc/mifup/functions/view/id/[NFUNC_ID] https://www.nite.go.jp/nbrc/mifup/rules/view/id/[NRULE_ID] https://www.nite.go.jp/nbrc/mifup/microbes/view/nbrc/[Microbe_ID] |
| 外部リンク | なし |
| 論文等（PubMed ID） | なし |
| 稼働状況 | 稼働中 |
＜前へ
次へ＞