データベース

TOT-DB

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成果物名TOT-DB
成果物の別名The Theileria orientalis Genome Annotation Database
成果物に関する説明TOT-DB (The Theileria orientalis Genome Annotation Database)は、寄生性原虫タイレリア・オリエンタリスの遺伝子と転写産物を対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。ゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同検索やデータの一括ダウンロードも行えます。
成果物のタイプDB
運用機関北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力例メニュー[G-integra]からG-integraに移動し、"THEILERIA ORIENTALIS"の染色体をクリック
キーワードタイレリア・オリエンタリス | 寄生性原虫
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法12.02|http://totdb.czc.hokudai.ac.jp/download.html からファイルダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データ比較ゲノム
生物種"Theileria orientalis, Theileria parva, Theileria annulata"
利用条件不明
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2013/07/29 (2019/07/02)
利用できるIDTOT
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:22951932
稼働状況運用終了