データベース

MCG CNV Database

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成果物名MCG CNV Database
成果物の別名なし
成果物に関する説明"本データベースは、日本人の健常者集団を対象として独自開発したBACアレイ( MCGアレイ )1) ならびにSNPアレイ (illumina, HumanOmniExpress Beadchip)を用いた解析を行い、 検出された CNVと LOHを収載したものです。このことにより、日本人健常者集団におけるCNVやLOHの出現頻度を示し、 ゲノム解析において検出されるゲノム変化が病態と関連するかどうかを判断するための基盤情報となります(オリジナルサイトより引用)。"
成果物のタイプDB
運用機関東京医科歯科大学
機関所在国日本
サイトURLhttp://www.cghtmd.jp/CNVDatabase/top!changeJaLocale
インターフェイスGUI
入力例ステップ1.画面上部の[Data View]メニューをクリックする。ステップ2.表示された染色体図の適切な個所をクリックする。
キーワードCNV|BAC|MCG|SNP|de novo|家系|イルミナ
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースGenesymbol|Refseq|Database of Genomic Variants
主な対象データDNA-多型 アレイ
生物種"Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]"
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)1回/1年
最終更新日(調査日)2013/03/00 (2019/07/03)
利用できるIDClone ID (original)
IDを使った成果物の利用方法http://www.cghtmd.jp/CNVDatabase/cnv-chrom-map.action#[Clone ID]
外部リンクUCSC(http://genome.ucsc.edu/)|NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)|Database of Genomic Variants(http://projects.tcag.ca)
論文等(PubMed ID)pmid:15245590
稼働状況稼働中