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TMBETA-DISC

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成果物名TMBETA-DISC
成果物の別名なし
成果物に関する説明アミノ酸配列からベータバレル構造タンパクを識別する統計的かつSVM法をベースとした手法を開発しました。アミノ酸構成であるresidue pair preferenceとモチーフがこのプログラムの主な特徴です。TMBETADISC-COMP、TMBETADISC-DIPEPTIDE、TMBETADISC-MOTIF、TMBETADISC-SVM、TMBETADISC-RBFの5種のプログラムがあります。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力例TMBETADISC-RBFの入力例:テキストボックスにFASTAフォーマットのアミノ酸配列を入力して、submitボタンをクリックする。サンプルの配列は画面下段にあります。
キーワードSVM | amino acid composition | residue pair composition | motif composition | PSSM
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0|なし
使っている外部リソースなし
主な対象データタンパク質-アミノ酸特性
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2015/08/20 (2019/07/02)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:18434251 | pmid:16204348 | pmid:15980447 | pmid:15833441 | pmid:15531602
稼働状況運用終了