成果物名 | TMBETA-DISC |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | アミノ酸配列からベータバレル構造タンパクを識別する統計的かつSVM法をベースとした手法を開発しました。アミノ酸構成であるresidue pair preferenceとモチーフがこのプログラムの主な特徴です。TMBETADISC-COMP、TMBETADISC-DIPEPTIDE、TMBETADISC-MOTIF、TMBETADISC-SVM、TMBETADISC-RBFの5種のプログラムがあります。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | GUI |
入力例 | TMBETADISC-RBFの入力例:テキストボックスにFASTAフォーマットのアミノ酸配列を入力して、submitボタンをクリックする。サンプルの配列は画面下段にあります。 |
キーワード | SVM | amino acid composition | residue pair composition | motif composition | PSSM |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0|なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | タンパク質-アミノ酸特性 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
最終更新日(調査日) | 2015/08/20 (2019/07/02) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:18434251 | pmid:16204348 | pmid:15980447 | pmid:15833441 | pmid:15531602 |
稼働状況 | 運用終了 |