データベース

JSNP DATABASE

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成果物名JSNP DATABASE
成果物の別名JSNP
成果物に関する説明日本人一般集団786人を対象に遺伝子型の決定を行い、アレル(対立遺伝子)頻度のデータを第9回公開から提供しています。NEDOプロジェクトの成果(データ)が一部含まれています。
成果物のタイプDB
運用機関東京大学 | 科学技術振興機構
機関所在国日本
サイトURLhttps://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/jsnp/desc.html
インターフェイスGUI
入力例サイトURL画面上部検索テキストボックスに”BRCA1”を入力して、[検索]ボタンを押す。
キーワードSNPs
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法14.1|http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/data_download_ja.htmlからファイルダウンロード
使っている外部リソースNCBI | Ensembl | dbSNP
主な対象データDNA-多型 アレル(対立遺伝子)頻度
生物種"Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]"
利用条件表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間)2
最終更新日(調査日)2014/05/08 (2019/07/02) 運用終了、アーカイブ化
利用できるIDJSNP ID
IDを使った成果物の利用方法http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/SnpInfo.cgi?SNP_ID=[JSNP ID]
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:12436197 | pmid:11752280 | pmid:12426569
稼働状況アーカイブ化