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Evola

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成果物名Evola
成果物の別名Evola: Evolutionary annotation database
成果物に関する説明Evola (Evolutionary annotation database)はH-InvDBのサブデータベースの1つとして、ヒト遺伝子の分子進化アノテーション情報を格納しています。ヒトと14のモデル生物とのオーソログについて、アラインメントや系統樹、正負の自然選択情報を提供しています。オーソログ解析対象の生物はヒト、チンパンジー、オランウータン、マカクザル、マウス、ラット、イヌ、ウマ、ウシ、オポッサム、ニワトリ、ゼブラフィッシュ、メダカ、ミドリフグ、トラフグです。
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://www.h-invitational.jp/evola/search_jp.html
インターフェイスGUI
入力例トップ/サーチページ上部の"Evola Search ortholog by"で、プルダウンメニューから"Keyword (Human)"を選び、テキストボックスに"calmodulin"を入力して"submit"ボタンを押す。
キーワードオルソログ | パラログ | 比較ゲノム | 脊椎動物
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法223.8|http://www.h-invitational.jp/evola/download_jp.html
使っている外部リソースH-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC
主な対象データ比較ゲノム
生物種"Homo sapiens | Pan troglodytes | Pongo abelii | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Equus caballus [Taxonomy_id: 9796, ウマ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883]"
利用条件表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間)8
最終更新日(調査日)2010/12/03 (2019/07/04)
利用できるIDH-Inv transcript ID (HIT) | Accession Number | HUGO gene symbol
IDを使った成果物の利用方法http://h-invitational.jp/hinv/evola/annotation?AccessionNum=[HIT]
外部リンクH-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC
論文等(PubMed ID)pmid:17982176
稼働状況稼働中