成果物名 | Evola |
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成果物の別名 | Evola: Evolutionary annotation database |
成果物に関する説明 | Evola (Evolutionary annotation database)はH-InvDBのサブデータベースの1つとして、ヒト遺伝子の分子進化アノテーション情報を格納しています。ヒトと14のモデル生物とのオーソログについて、アラインメントや系統樹、正負の自然選択情報を提供しています。オーソログ解析対象の生物はヒト、チンパンジー、オランウータン、マカクザル、マウス、ラット、イヌ、ウマ、ウシ、オポッサム、ニワトリ、ゼブラフィッシュ、メダカ、ミドリフグ、トラフグです。 |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 産業技術総合研究所(AIST) 創薬分子プロファイリング研究センター(molprof) |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://www.h-invitational.jp/evola/search_jp.html |
インターフェイス | GUI |
入力例 | トップ/サーチページ上部の"Evola Search ortholog by"で、プルダウンメニューから"Keyword (Human)"を選び、テキストボックスに"calmodulin"を入力して"submit"ボタンを押す。 |
キーワード |
オルソログ | パラログ | 比較ゲノム | 脊椎動物
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ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 223.8|http://www.h-invitational.jp/evola/download_jp.html |
使っている外部リソース | H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC |
主な対象データ | 比較ゲノム |
生物種 |
"Homo sapiens | Pan troglodytes | Pongo abelii | ...
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利用条件 | 表示-継承 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 8 |
最終更新日(調査日) | 2010/12/03 (2010/12/06) |
利用できるID |
H-Inv transcript ID (HIT) | Accession Number | HUGO gene symbol
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IDを使った成果物の利用方法 | http://h-invitational.jp/hinv/evola/annotation?AccessionNum=[HIT] |
外部リンク | H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC |
論文等(PubMed ID) |